تتجلى إحدى أبرز نقاط الخلاف بين تشافي هيرنانديز وجوان لابورتا في عدم نجاح عودة ليونيل ميسي إلى برشلونة في عام 2023 حيث أشار تشافي إلى أن لابورتا كان له دور في عرقلة الصفقة رغم موافقة الدوري الإسباني عليها بينما يتمسك لابورتا برأيه بأن القرار كان مدفوعًا بالاعتبارات المالية بالإضافة إلى مخاوف ميسي بشأن الضغط الذي قد يواجهه عند العودة إلى النادي الذي نشأ فيه.
في توضيحه، قال لابورتا إن ميسي أبدى رغبته في العودة بعد عدم تمكن النادي من تجديد عقده لأسباب مالية وأوضح أنه أرسل العقد إلى خورخي ميسي والد اللاعب الذي زاره لاحقًا وأخبره بأن الضغط سيكون كبيرًا في حال عودته وهذا يتناقض مع ادعاء تشافي بأن الصفقة كانت قريبة من الإتمام قبل أن يتدخل لابورتا ويوقفها في اللحظة الأخيرة.
استمر التوتر بين تشافي ولابورتا في سوق الانتقالات حيث أعرب تشافي عن استيائه من عدم تحقيق أهدافه في التعاقد مع لاعبين مثل مارتن زوبيمندي الذي يبرز أداؤه مع أرسنال تحت قيادة ميكيل أرتيتا وأكد تشافي أن محاولاته للتعاقد مع لاعب الوسط قد قوبلت بالرفض من قبل الإدارة بسبب القيود المالية بينما رد لابورتا بأن تشافي فقد الثقة في الفريق الذي لديه وأصبح ينتقد قدرة اللاعبين على المنافسة مع ريال مدريد.
كما أضاف لابورتا أن تشافي أصبح متعجرفًا ولم يستطع إدارة التوازن بين حياته المهنية والشخصية مشيرًا إلى أن تشافي اعتبر أن برشلونة لن يتمكن من منافسة ريال مدريد وطلب تغييرات في الفريق بينما أخبره لابورتا بأنه لا يمكنه الاستمرار في هذا الاتجاه وأكد أن تشافي كان غير راضٍ عن أداء الفريق والحكام مما جعل هذا الموضوع يتكرر في حديثهما.