فضاءات قرآنية تحمل في طياتها مجموعة من المخطوطات القيمة التي تتعلق بتفسير القرآن الكريم، ومن بين هذه المخطوطات نجد “لباب التأويل في معاني التنزيل” و”التيسير في التفسير” لعمر النسفي، بالإضافة إلى “حل الإشكالات في فهم بعض الآيات” التي تعود إلى القرن الثاني عشر الهجري، وكذلك “البحر المديد في تفسير القرآن المجيد” لأحمد بن محمد بن عجيبة، و”معالم التنزيل في التفسير والتأويل” للحسين بن مسعود البغوي، و”تقريب المأمول في ترتيب النزول” لإبراهيم بن عمر، و”تفسير غريب القرآن ومعانيه” لمحمد بن عزيز السجستاني.
توجد أيضًا مخطوطات نادرة مثل “أدب الأفنان المقتطف من روح البيان” و”تقييد على البسملة” و”تفسير الجلالين” و”اللباب في مشكلات الكتاب” و”الدر المصون في علوم الكتاب المكنون”، بالإضافة إلى “تفسير مشكل إعراب القرآن” و”بيان الاصطلاحات المخصوصة ببطن القرآن” و”النجاتي في تفسير جزء عم”، و”حاشية على أنوار التنزيل للبيضاوي” و”حاشية على أنوار التنزيل وأسرار التأويل” و”خزائن الجواهر ومخازن الزواهر”، وكذلك “تفسير سورة الفاتحة” و”الدر المنثور في التفسير بالمأثور” و”الجواهر الحسان في تفسير القرآن” و”فائدة تتعلق بآية الكرسي” و”الكهف والرقيم في شرح بسم الله الرحمن الرحيم” و”تفسير الشيخ التملي السندي على الخمسمائة آية” و”اللوامع والأسرار في منافع القرآن والأخبار” وغيرها من المخطوطات الكثيرة النادرة التي تعكس عمق الفكر الإسلامي في مجال التفسير.